Các trạm thu phí gồm: Trạm Nam Cầu Giẽ (Hà Nam), Lường Mẹt (Lạng Sơn), Cầu Bình (Hải Dương), Phú Bài (Thừa Thiên Huế), Bắc hầm Hải Vân (Đà Nẵng), Cầu Gianh (Quảng Bình), Sân bay Đà Nẵng và Tân Sơn Nhất và trạm thu phí T1- QL51 (Đồng Nai). Dịch vụ thu phí cầu đường tự động ứng dụng thiết bị không dừng - OBU, khi lưu thông qua trạm, phương tiện không phải dừng lại để mua và trả vé mà được thực hiện tự động thông qua kết nối giữa tài khoản thanh toán tại ngân hàng và một thiết bị thẻ OBU nhỏ gọn được gắn ở trên xe.
