VCBC được hạch toán phụ thuộc và có con dấu riêng; được mở tài khoản tiền gửi thanh toán tại Sở giao dịch NHNN để thực hiện nghiệp vụ nộp, rút tiền mặt và một số nghiệp vụ chức năng, nhiệm vụ khác theo quy định của Vietcombank và quy định của pháp luật. VCBC có cơ cấu tổ chức như sau: Ban Giám đốc (01 Giám đốc, 02 Phó Giám đốc), 03 Phòng chức năng gồm: Phòng Xử lý tiền mặt; Phòng Hành chính quản trị và Giao nhận; Phòng Kế toán và Dịch vụ khách hàng; Với chức năng: là đơn vị đầu mối của Vietcombank thực hiện giao dịch tiền mặt VND với NHNN, CN, khách hàng và thực hiện xuất, nhập khẩu tiền mặt ngoại tệ với ngân hàng, tổ chức tài chính nước ngoài theo quy định của Vietcombank; thực hiện giao nhận, bảo quản, kiểm đếm, phân loại, đóng bó, vận chuyển tiền mặt trong giao dịch nội bộ Vietcombank; tiếp quỹ, kiểm quỹ cho hệ thống ATM theo quy định về quản lý ngân quỹ hiện hành của Vietcombank.
Nhằm hướng tới mục tiêu là trở thành ngân hàng số 1 Việt Nam, 1 trong 300 tập đoàn tài chính ngân hàng lớn nhất thế giới và được quản trị theo các thông lệ quốc tế tốt nhất vào năm 2020. Việc thành lập Trung tâm Xử lý tiền mặt Vietcombank là một bước chuyển lớn để Vietcombank tiếp tục khẳng định thế mạnh và sự bứt phá của mình trong những năm tới.