Tham dự vòng loại U16 châu Á 2020 có tổng cộng 47 đội và được vào 11 bảng căn cứ theo khu vực địa lý. Cụ thể, khu vực Đông Á gồm 22 đội được chia vào 5 bảng (2 bảng 5 đội và 3 bảng 4 đội) và khu vực Tây Á gồm 25 đội được chia vào 6 bảng (3 bảng 5 đội và 3 bảng 4 đội).
Các đội sẽ thi đấu theo thể thức vòng tròn 1 lượt tính điểm xếp hạng tại mỗi bảng. Đội xếp thứ nhất tại mỗi bảng (11 đội) và 4 đội xếp thứ nhì có thành tích tốt nhất trong tổng số 11 bảng sẽ giành quyền tham dự Vòng chung kết. Suất vé thứ 16 thuộc về đội tuyển U16 của quốc gia chủ nhà Vòng chung kết.
Trong trường hợp đội tuyển U16 của quốc gia chủ nhà Vòng chung kết (hiện chưa xác định) nằm trong nhóm 11 đội đầu bảng hoặc nhóm 4 đội nhì xuất sắc tại vòng loại, suất vé thứ 16 sẽ thuộc về đội xếp thứ 5 trong nhóm 11 đội nhì bảng tại vòng loại.
Cũng theo Điều lệ, khi tính thành tích để xếp hạng các đội nhì bảng, đối với nhóm bảng 5 đội, AFC sẽ loại trừ kết quả của đội thứ nhì với đội xếp cuối bảng để đảm bảo sự cân bằng với nhóm các bảng đấu có 4 đội.
Theo kế hoạch, lượt trận đầu tiên của nhóm bảng 5 đội sẽ bắt đầu vào ngày 14/9/2019. Sau đó 4 ngày (ngày 18/9/2019) sẽ là lượt trận khai màn của nhóm bảng 4 đội. Cuộc đua tại vòng loại sẽ kết thúc vào ngày 22/9/2019.
Tại vòng loại, LĐBĐ Việt Nam đã giành quyền đăng cai tổ chức bảng đấu của U16 Việt Nam. Đây cũng là điều kiện thuận lợi để các cầu thủ trẻ U16 Việt Nam cạnh tranh suất vé tham dự VCK, đấu trường mà các thế hệ đàn anh từng lọt vào tới bán kết năm 2000 và tứ kết năm 2016.
Thông tin về sự chuẩn bị của ĐT U16 Việt Nam và lịch thi đấu Vòng loại U16 châu Á 2020 sẽ tiếp tục được cập nhật.
