Mục tiêu của Đề án phấn đấu đến năm 2015, có trên 50% CCN đã và đang hoạt động được đầu tư xây hệ thống xử lý nước thải tập trung. Cụ thể trong 2 năm (2014 - 2015), đưa vào vận hành hệ thống xử lý nước thải tập trung tại 16 CCN (trong đó năm 2014 thực hiện tại 7 CCN và năm 2015 là 9 CCN).