Sau khi vụ cướp 2,2 tỷ đồng xảy ra, dư luận đặt ra câu hỏi về số tiền thu phí thực tế của tuyến cao tốc TP Hồ Chí Minh – Long Thành – Dầu Giây khác xa so với báo cáo của đơn vị khai thác. Sau đó, Tổng cục Đường bộ Việt Nam đã chỉ đạo kiểm tra. Đoàn kiểm tra của Tổng cục Đường bộ Việt Nam đã tiến hành kiểm tra hồ sơ thu phí từ ngày 28/1 đến ngày 8/2, nhằm thẩm tra tính minh bạch trong công tác thu phí tại trạm.
Kết quả, theo hồ sơ lưu từ ngày 28/1 đến ngày 8/2 tại trạm thu phí Dầu Giây thu được khoảng 13,271 tỉ đồng, trung bình một ngày đêm (gồm 3 ca) thu được 1,1 tỉ đồng. Đơn vị khai thác đã nộp vào tài khoản ngân hàng hơn 10,5 tỉ đồng.
Số tiền bị cướp ngày 7/2 là 2,22 tỉ đồng, tiền thu phí còn tồn quỹ 465,08 triệu đồng. Kết quả kiểm tra giấy tờ cho thấy chứng từ thu phí được lập đầy đủ theo quy định tại Quy trình tổ chức hoạt động thu phí đường cao tốc TP Hồ Chí Minh - Long Thành - Dầu Giây.
Trước đó, báo cáo về vụ cướp mà Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam (VEC) cho biết, ngày 7/2 tại trạm thu phí Dầu Giây xảy ra vụ cướp 2,22 tỉ đồng từ két của trạm. Cũng theo VEC tại thời điểm bị cướp, số tiền mặt có tại két phòng kế toán vé thẻ hơn 3,23 tỉ đồng, trong đó gồm tồn quỹ dự phòng khẩn cấp: 80,2 triệu đồng; doanh thu giữ lại để đổi tiền lẻ dịp tết là: 600 triệu đồng; số tiền thu phí của 8 ca từ ca 2 ngày 4/2 đến hết ca 3 ngày 6/2 là 2,55 tỉ đồng.
Tổng cục Đường bộ Việt Nam đánh giá con số trên trùng khớp đúng với báo cáo của VEC trước đó.