Giải nhất của năm 2012 được trao cho Tiến sĩ Trần Thị Phương Hoa - Viện Khoa học xã hội Việt Nam với luận án “Giáo dục Pháp - Việt ở Bắc Kỳ từ đầu thế kỷ 20 đến năm 1945”. Hai giải nhì thuộc về Tiến sĩ Bùi Thị Thu Phương với công trình nghiên cứu về “Đồ gốm văn hóa Phùng Nguyên” và Tiến sĩ Ngô Vương Anh với luận án “Đảng Cộng sản Việt Nam với việc thực hiện tư tưởng Hồ Chí Minh về cách mạng giải phóng dân tộc từ 1930-1945”.
Đến nay, đã có tổng số 68 tiến sĩ vinh dự được nhận giải thưởng sử học Phạm Thận Duật.
Đây là một trong những giải thưởng được coi duy nhất danh giá và có uy tín của Hội Khoa học lịch sử Việt Nam dành cho các công trình nghiên cứu lịch sử.
Từ năm 2010 đến nay, Quỹ Giải thưởng Phạm Thận Duật còn chủ động mở rộng việc xét thưởng Giải thưởng sử học Phạm Thận Duật cho thạc sĩ và cử nhân sử học.