Bước vào trận tái đấu với tuyển Indonesia trên sân Mỹ Đình, HLV Philippe Troussier chỉ có 2 sự thay đổi so với trận lượt đi khi Đình Bắc và Minh Trọng nhường chỗ cho Văn Khang và Văn Thanh.
Trong khung gỗ vẫn là thủ môn Nguyễn Filip, người đã chứng tỏ được chuyên môn kể từ khi được triệu tập trong màu áo tuyển Việt Nam. Những cầu thủ được lựa chọn quen thuộc là Việt Anh, Tiến Dũng, Tuấn Tài, Xuân Mạnh, Hùng Dũng, Thái Sơn, Hoàng Đức và Tiến Linh. Trường hợp gây tranh cãi nhiều nhất trong trận đấu vừa qua là Quang Hải tiếp tục ngồi dự bị.
Chiến thắng là mục tiêu của HLV Philippe Troussier và các học trò, ngay sau tiếng còi khai cuộc các cầu thủ đẩy cao đội hình để tìm kiếm bàn thắng. Trong khi đó, tuyển Indonesia cũng cho thấy tinh thần cao sau chiến thắng ở trận lượt đi để thi đấu đôi công với tuyển Việt Nam.
Phút thứ 3, các cầu thủ Indonesia tạo nên pha bóng lộn xộn trước khung thành tuyển Việt Nam nhưng các cầu thủ nhà đã kịp thời phá bóng lên. Tuyển Việt Nam có câu trả lời ở phút thứ 5 khi Văn Khang có pha dứt điểm vào góc hẹp nhưng không thắng được thủ môn đội khách.
Bất ngờ đến ở phút thứ 9, tuyển Indonesia có bàn thắng mở tỷ số sau pha đánh đầu của Idzes. Bàn thua khiến cả khán đài sân Mỹ Đình "chết lặng", tinh thần của tuyển Việt Nam càng đi xuống. Có được bàn thắng, các cầu thủ Indonesia chủ động lùi đội hình và nhường kiểm soát bóng cho tuyển Việt Nam. Tuy nhiên, thầy trò HLV Troussier không có được những tình huống tấn công sắc nét.
Phút thứ 24, Ragnar Oratmangoen có tình huống đột phá qua hàng loạt cầu thủ Việt Nam trước khi ghi bàn nâng tỷ số lên 2-0. Bàn thua thứ 2 khiến tuyển Việt Nam khó khăn chồng chất, đặc biệt khi đối thủ thi đấu hơn hẳn so với tuyển Việt Nam.
Nhận 2 bàn thua nhưng các cầu thủ Việt Nam thi đấu mờ nhạt, lối chơi không cải thiện và không tạo ra quá nhiều cơ hội về phía khung thành đối thủ.
Bước vào hiệp 2, tuyển Việt Nam có sự thay đổi khi Thái Sơn nhường chỗ cho Thành Long. Quang Hải vẫn ngồi dự bị dù thế trận của tuyển Việt Nam không cải thiện so với hiệp thi đấu đầu tiên. Thận chí, Quang Hải không được tung vào sân khiến nhiều cổ động viên tiếc nuối. Trên khán đài, nhiều tấm băng rôn có nội dung đòi đuổi HLV Philippe Troussier được cổ động viên căng lên.
Phút thứ 63, Bùi Hoàng Việt Anh có cơ hội trong vòng cấm tuyển Indonesia nhưng cú dứt điểm của anh đã đi ra ngoài. Ở những phút còn lại, tuyển Việt Nam đẩy cao đội hình với sự cơ động của Văn Toàn bên cánh phải. Nhiều tình huống nguy hiểm được tạo ra nhưng các chân sút của tuyển Việt Nam tỏ ra khá vô duyên.
Ở những phút thi đấu bù giờ cuối cùng, tuyển Indonesia có thêm bàn thắng thứ 3. Khép lại trận đấu, tuyển Việt Nam để thua tuyển Indonesia với tỷ số 0 - 3. Đây là trận thua thứ 3 liên tiếp của tuyển Việt Nam khi đối đầu với đội bóng của HLV Shin Tae-yong. Trận thua này khiến tuyển Việt Nam gặp khó trong cuộc giành vé đi tiếp vào vòng 3 tại F.