Hội nghị Cấp cao Ủy hội sông Mekong quốc tế lần thứ nhất đã được tổ chức vào năm 2010 tại TP Hua Hin, Thái Lan.
Hội nghị Cấp cao Ủy hội sông Mekong quốc tế lần thứ hai diễn ra năm 2014 tại TP Hồ Chí Minh, với chủ đề “An ninh nước, năng lượng, lương thực trong bối cảnh biến đổi khí hậu của lưu vực sông Mekong".