Hiện chỉ còn một cơ sở là Bệnh viện Đống Đa đang trong quá trình vận hành thử nghiệm trạm xử lý nước thải. Trong số 18 cơ sở đã cơ bản xử lý khắc phục tình trạng ô nhiễm môi trường, có 17/18 cơ sở đã có quyết định chứng nhận hoàn thành xử lý ô nhiễm triệt để, hiện nay còn 1 cơ sở thuộc lưu vực sông Nhuệ - Đáy đang tiếp tục hoàn thiện thủ tục để cấp giấy chứng nhận là Công ty cồn rượu Hà Nội.
